MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549

Total Repeats: 1059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017493	ATT	2	6	8	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017493	TTATA	2	10	14	23	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017493	A	10	10	48	57	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017493	A	6	6	96	101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017493	A	6	6	118	123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017493	A	6	6	140	145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017493	TTA	2	6	191	196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017493	TTTA	2	8	197	204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017493	GAAA	2	8	246	253	75 %	0 %	25 %	0 %	385836927
10	NC_017493	AAGG	2	8	278	285	50 %	0 %	50 %	0 %	385836927
11	NC_017493	AGCT	2	8	352	359	25 %	25 %	25 %	25 %	385836927
12	NC_017493	CTC	2	6	382	387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385836927
13	NC_017493	ATA	2	6	394	399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836927
14	NC_017493	A	6	6	413	418	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
15	NC_017493	ATT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
16	NC_017493	T	7	7	431	437	0 %	100 %	0 %	0 %	385836927
17	NC_017493	TGATAA	2	12	446	457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385836927
18	NC_017493	TCG	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836927
19	NC_017493	A	6	6	484	489	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
20	NC_017493	T	6	6	503	508	0 %	100 %	0 %	0 %	385836927
21	NC_017493	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
22	NC_017493	A	6	6	644	649	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
23	NC_017493	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
24	NC_017493	TA	3	6	712	717	50 %	50 %	0 %	0 %	385836927
25	NC_017493	GAA	2	6	776	781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
26	NC_017493	ATA	2	6	810	815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836927
27	NC_017493	TGA	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
28	NC_017493	TAG	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
29	NC_017493	A	6	6	877	882	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
30	NC_017493	AAAT	2	8	907	914	75 %	25 %	0 %	0 %	385836927
31	NC_017493	A	7	7	942	948	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
32	NC_017493	A	7	7	950	956	100 %	0 %	0 %	0 %	385836927
33	NC_017493	ATG	2	6	1030	1035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836927
34	NC_017493	GAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
35	NC_017493	TGT	2	6	1138	1143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836927
36	NC_017493	GAA	2	6	1267	1272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836927
37	NC_017493	ATT	2	6	1282	1287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836927
38	NC_017493	GAA	2	6	1381	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017493	AGAA	2	8	1398	1405	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017493	T	6	6	1428	1433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017493	AGT	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017493	GGT	2	6	1555	1560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836928
43	NC_017493	ATA	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836928
44	NC_017493	ATT	2	6	1623	1628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
45	NC_017493	A	6	6	1646	1651	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
46	NC_017493	ATTTTA	2	12	1679	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
47	NC_017493	CTA	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836928
48	NC_017493	A	7	7	1757	1763	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
49	NC_017493	AGA	2	6	1794	1799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
50	NC_017493	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836928
51	NC_017493	ATT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
52	NC_017493	TTAT	2	8	1843	1850	25 %	75 %	0 %	0 %	385836928
53	NC_017493	A	6	6	1860	1865	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
54	NC_017493	ATTAT	2	10	1892	1901	40 %	60 %	0 %	0 %	385836928
55	NC_017493	TTA	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
56	NC_017493	A	6	6	2037	2042	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
57	NC_017493	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836928
58	NC_017493	T	6	6	2094	2099	0 %	100 %	0 %	0 %	385836928
59	NC_017493	A	6	6	2154	2159	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
60	NC_017493	ATG	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836928
61	NC_017493	AAG	2	6	2192	2197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
62	NC_017493	CTT	2	6	2215	2220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836928
63	NC_017493	ATT	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836928
64	NC_017493	AGA	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836928
65	NC_017493	AAAT	2	8	2271	2278	75 %	25 %	0 %	0 %	385836928
66	NC_017493	CAT	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836928
67	NC_017493	A	7	7	2292	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	385836928
68	NC_017493	ATA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017493	AGT	2	6	2383	2388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017493	A	6	6	2389	2394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017493	ATA	2	6	2406	2411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017493	A	7	7	2432	2438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017493	A	8	8	2458	2465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017493	A	7	7	2494	2500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017493	ATT	2	6	2525	2530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017493	A	6	6	2544	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017493	GAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017493	AGA	2	6	2696	2701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017493	TTA	2	6	2707	2712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017493	GTAG	2	8	2719	2726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017493	GAT	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017493	A	6	6	2835	2840	100 %	0 %	0 %	0 %	385836929
83	NC_017493	TGA	2	6	2882	2887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836929
84	NC_017493	CAT	2	6	2897	2902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
85	NC_017493	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
86	NC_017493	TA	3	6	2968	2973	50 %	50 %	0 %	0 %	385836929
87	NC_017493	TCA	2	6	3085	3090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
88	NC_017493	TTC	2	6	3093	3098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836929
89	NC_017493	CCCT	2	8	3108	3115	0 %	25 %	0 %	75 %	385836929
90	NC_017493	AAT	2	6	3134	3139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
91	NC_017493	TTC	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836929
92	NC_017493	AAT	2	6	3189	3194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
93	NC_017493	ATT	2	6	3243	3248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
94	NC_017493	CTTT	2	8	3311	3318	0 %	75 %	0 %	25 %	385836929
95	NC_017493	AGA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836929
96	NC_017493	T	6	6	3364	3369	0 %	100 %	0 %	0 %	385836929
97	NC_017493	TAA	2	6	3476	3481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836929
98	NC_017493	TAT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836929
99	NC_017493	ATTTT	2	10	3529	3538	20 %	80 %	0 %	0 %	385836929
100	NC_017493	T	7	7	3535	3541	0 %	100 %	0 %	0 %	385836929
101	NC_017493	GAT	2	6	3547	3552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836929
102	NC_017493	ACT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836929
103	NC_017493	GAC	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836929
104	NC_017493	CAA	2	6	3770	3775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017493	GTT	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017493	AACA	2	8	3957	3964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017493	TTTTGA	2	12	4046	4057	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017493	A	6	6	4087	4092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017493	TATTTA	2	12	4103	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017493	AT	4	8	4117	4124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017493	GTG	2	6	4146	4151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017493	TA	3	6	4175	4180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017493	A	6	6	4195	4200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017493	A	6	6	4217	4222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017493	A	6	6	4239	4244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017493	A	6	6	4269	4274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017493	ATA	2	6	4291	4296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017493	A	6	6	4386	4391	100 %	0 %	0 %	0 %	385836930
119	NC_017493	ACA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836930
120	NC_017493	GT	3	6	4417	4422	0 %	50 %	50 %	0 %	385836930
121	NC_017493	GAAA	2	8	4428	4435	75 %	0 %	25 %	0 %	385836930
122	NC_017493	AGAAA	2	10	4439	4448	80 %	0 %	20 %	0 %	385836930
123	NC_017493	TTG	2	6	4451	4456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836930
124	NC_017493	TCA	2	6	4469	4474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836930
125	NC_017493	ATT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
126	NC_017493	T	7	7	4596	4602	0 %	100 %	0 %	0 %	385836930
127	NC_017493	AAG	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
128	NC_017493	A	6	6	4649	4654	100 %	0 %	0 %	0 %	385836930
129	NC_017493	T	7	7	4668	4674	0 %	100 %	0 %	0 %	385836930
130	NC_017493	AAG	2	6	4682	4687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
131	NC_017493	TGGAA	2	10	4736	4745	40 %	20 %	40 %	0 %	385836930
132	NC_017493	TTGA	2	8	4798	4805	25 %	50 %	25 %	0 %	385836930
133	NC_017493	AGTA	2	8	4858	4865	50 %	25 %	25 %	0 %	385836930
134	NC_017493	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
135	NC_017493	G	6	6	4930	4935	0 %	0 %	100 %	0 %	385836930
136	NC_017493	TACT	2	8	4997	5004	25 %	50 %	0 %	25 %	385836930
137	NC_017493	AGA	2	6	5067	5072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
138	NC_017493	AGA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
139	NC_017493	TTA	2	6	5248	5253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
140	NC_017493	AGTA	2	8	5269	5276	50 %	25 %	25 %	0 %	385836930
141	NC_017493	ATT	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836930
142	NC_017493	AAG	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836930
143	NC_017493	A	6	6	5479	5484	100 %	0 %	0 %	0 %	385836930
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151	NC_017493	A	6	6	5791	5796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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